L'oratorio sorge in posizione marginale rispetto al fitto tessuto edilizio del centro storico di Varzi. La chiesa venne costruito per volere della Confraternita dei Santi Sebastiano e Rocco nel 1636. Risalta la sua facciata, divisa in due ordini da una cornice aggettante, sorretta da lesene in pietra, come tutto l'ordine inferiore su cui si aprono il portale centrale e due nicchie laterali, sovrastate da affreschi: a sinistra San Sebastiano, a destra San Rocco, santi titolari.
L'ordine superiore è caratterizzano da una finestra centrale e nicchie laterali con statue e di santi.
Il campanile settecentesco è facilmente individuabile anche da lontano e connota il profilo del borgo.
L'interno è sobrio, in stile barocco lombardo, in linea con i precetti della controriforma, ad aula unica, con altari laterali.
Una elaborata balaustra in marmi policromi separa la navata dall'area presbiteriale. Sulla parte di fondo la tela con Dio padre e i Santi Sebastiano e Rocco.
Il coro riccamente intagliato, con 18 stalli, è del 1785. Si vede ancora la tabella di confraternita, qui erano riportati i nomi dei confratelli e le rispettive cariche.
La pavimentazione è di tipo alla genovese con decori policromi.