Museo ecclesiastico, indica una raccolta organizzata di oggetti di interesse storico-artistico e, più raramente, un istituto di conservazione e valorizzazione del patrimonio culturale di proprietà ecclesiastica.
Le opere esposte possono essere di carattere religioso e inerenti al territorio in cui il museo è ubicato, oppure essere collezioni di vario genere (archeologico, etnografico, bibliografico) frutto di donazioni private o provenienti da vari paesi del mondo, come nel caso delle missioni. Il museo può essere autonomo e dotato di personalità giuridica, oppure parte integrante dell’ente ecclesiastico di riferimento (diocesi, ordine o congregazione religiosa).